O Código de Direito Canônico orienta da seguinte forma a formação do futuros padres:
Cân. 234 § 1. Conservem-se, onde existirem, e fomentem-se os seminários menores ou outros institutos semelhantes, nos quais se providencie, para incentivar as vocações, que se dê formação religiosa especial juntamente com a preparação humanística e científica; e mais, onde o Bispo diocesano o julgar oportuno, proveja à fundação do seminário menor ou instituto semelhante.
Cân. 235 § 1. Os jovens que pretendem ser admitidos ao sacerdócio sejam educados para uma formação espiritual adequada e para os ofícios que lhes são próprios, no seminário maior durante todo o tempo da formação ou, se a juízo do Bispo diocesano o exigirem as circunstâncias, ao menos por quatro anos.
Para a formação dos futuros padre de nossa diocese, temos o seminário Menor e Propedêutico em nosso seminário Diocesano São José, em Assis. Depois desse período, os seminaristas vão para a cidade de Marília, onde estudam Filosofia e Teologia na Faculdade João Paulo II (FAJOPA), cuja matenedora são os bispos da Provincia Eclesiastica de Botucatu. Os seminaristas de Filosofia residem no Seminário Provincial Sagrado Coração de Jesus (SPSCJ) e os de Teologia residem do Instituto Teológico Rainha dos Apóstolos (ITRA).
No seminário, todos esses jovens serão acompanhados pelos padres formadores principalmente pelo reitor, e continuarão o discernimento vocacional que já haviam iniciado através dos encontros vocacionais. O Seminário São José oferece aos jovens que ainda não concluíram o ensino médio o ensino regular no Colégio Ressurreição Santa Maria e aos que já terminaram o ensino médio, o curso chamado de Propedêutico com algumas disciplinas introdutórias nas áreas de Sagrada Escritura, Latim, Espiritualidade e também em preparação para o vestibular como: História e Língua Portuguesa.
É muito importante que todas as comunidades rezem por esses jovens que vivenciam um momento muito especial em suas vidas, procurando refletir sobre sua vocação. E não devemos apenas rezar por esse, mas também para que Jesus continue chamando jovens corajosos para essa importante missão, assim cumprimos a ordem de Jesus que nos ensinou a pedir ao dono da messe para que envie operário (Cf. Lucas 10,2).
Se você conhece algum jovem que demonstra sinais de vocação, o convide para conversar com o padre de sua paróquia, ou mesmo se você jovem sente o desejo de ser padre procure o sacerdote afim de que ele possa orientá-lo para o acompanhamento vocacional. O Seminário São José irá realizar ao longo deste ano os encontros vocacionais, nessas oportunidades o jovem poderá conhecer o seminário e realizar o seu discernimento vocacional para um futuro ingresso no seminário. Divulgue as datas dos encontros na sua paróquia, nos grupos de oração, nos grupos de jovens, nas escolas, pois todos nós somos responsáveis pelos futuros sacerdotes.
Propedêutico

JOÃO VICTOR DOS SANTOS GONÇALVES
Data Nasc.03/03/2005
Paróquia de Origem: PARÓQUIA NOSSA SENHORA DE FÁTIMA - ASSIS/SP
Nome do Pai: EVANDRO ALAN DA SILVA GONÇALVES
Nome da Mãe: MARINA APARECIDA DOS SANTOS
Filosofia

2° ANO DE FILOSOFIA - FELIPE MARTINS NEGRÃO
Data Nasc.18/03/2003
Paróquia de Origem: PARÓQUIA NOSSA SENHORA DE FÁTIMA - ASSIS/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA NOSSA SENHORA DAS GRAÇAS - SANTUÁRIO - ASSIS/SP
Nome do Pai: LUCIANO NOGUEIRA NEGRÃO
Nome da Mãe: EDNA MARIA ALVES MARTINS

2° ANO DE FILOSOFIA - GABRIEL OSWALDO DOS SANTOS DANELON
Data Nasc.25/07/2002
Paróquia de Origem: PARÓQUIA NOSSA SENHORA DO PATROCÍNIO - MARACAÍ/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA SÃO SEBASTIÃO - PALMITAL/SP
Nome do Pai: OSWALDO DANELON FILHO
Nome da Mãe: MARILZA DOS SANTOS DANELON

FILOSOFIA - MARCOS HENRIQUE DE LIMA
Data Nasc.31/10/1997
Paróquia de Origem: PARÓQUIA SÃO NICOLAU - ASSIS/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA NOSSA SENHORA APARECIDA - ASSIS/SP
Nome do Pai: MARCOS APARECIDO DE LIMA
Nome da Mãe: MARIA JOSÉ LUNA DE LIMA
Teologia

1º ANO DE TEOLOGIA - ALISON FERNANDO RODRIGUES DOS SANTOS
Data Nasc. 26/10/1993
Paróquia de Origem: PARÓQUIA NOSSA SENHORA DA BOA ESPERANÇA - LUTÉCIA/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA SÃO JOSÉ - FLORÍNEA/SP
Nome do Pai: FERNANDO FRANCISCO DOS SANTOS
Nome da Mãe: RITA DE CÁSSIA RODRIGUES DOS SANTOS

2º ANO DE TEOLOGIA - CAIO CEZAR GIL
Data Nasc. 04/12/1987
Paróquia de Origem: PARÓQUIA SANTO ANTÔNIO - QUATÁ/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA NOSSA SENHORA DO PATROCÍNIO - MARACAÍ/SP
Nome do Pai: ISAÍAS GIL DE OLIVEIRA
Nome da Mãe: OSMARINA GIL DE OLIVEIRA
E-mail: caiocezargil@hotmail.com

2º ANO DE TEOLOGIA - JOSÉ ANTÔNIO PEREIRA DE FREITAS
Data Nasc. 25/08/2000
Paróquia de Origem: PARÓQUIA SÃO SEBASTIÃO - PALMITAL/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA SAGRADO CORAÇÃO DE JESUS - CATEDRAL DE ASSIS - ASSIS/SP
Nome do Pai: ROBERTO BENEDITO DE FREITAS
Nome da Mãe: MARILDA PEREIRA DE FREITAS

2º ANO DE TEOLOGIA - LEANDRO ROBERTO ALVIM MONTEIRO
Data Nasc. 29/01/2000
Paróquia de Origem: PARÓQUIA NOSSA SENHORA DA BOA ESPERANÇA - LUTÉCIA/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA SÃO DONATO - PEDRINHAS PAULISTA/SP
Nome do Pai: BENEDITO JOSÉ MONTEIRO
Nome da Mãe: MONICA APARECIDA ALVIM MONTEIRO

3° ANO DE TEOLOGIA - IGOR COUTINHO PRADO
Data Nasc. 18/07/1991
Paróquia de Origem: PARÓQUIA SANTA CECÍLIA - ASSIS/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA SÃO JOÃO BATISTA - JOÃO RAMALHO/SP
Nome do Pai: LUIZ FLORÊNCIO PRADO
Nome da Mãe: NEUSA COUTINHO PRADO

4 º ANO DE TEOLOGIA - DEIVIDY SALES DUTRA
Data Nasc. 20/04/1988
Paróquia de Origem: PARÓQUIA SANTO ANTÔNIO - RANCHARIA/SP
Paróquia de Pastoral: CAPELA SÃO FRANCISCO DE ASSIS - ASSIS/SP
Nome do Pai: WILSON APARECIDO DUTRA
Nome da Mãe: MARIA LÚCIA SALES DUTRA

4º ANO DE TEOLOGIA - RONALDO VIEIRA GONÇALVES DE PASSOS
Data Nasc. 17/07/1994
Paróquia de Origem: PARÓQUIA SANTO ANTÔNIO - QUATÁ/SP
Paróquia de Pastoral: PARÓQUIA SAGRADO CORAÇÃO DE JESUS - CATEDRAL DE ASSIS - ASSIS/SP
Nome do Pai: HILDEBRANDO GONÇALVES DE PASSOS
Nome da Mãe: MARIA ZILDA SENA VIEIRA GONÇALVES DE PASSOS
E-mail: rronaldopassos@gmail.com